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水專項研發了針對特定地區的系列養殖污染防治成套技術,針對單項技術多、成套技術缺乏的問題,包括基于無害化微生物發酵床的養殖廢物全循環、畜禽養殖廢物異位微生物發酵床處理與資源化利用、東北寒冷地區畜禽養殖污染系統控制和山地果畜結合區面源污染控制等技術。攻克了微生物發酵床生態養殖、飼料微生物添加和養殖物及廢棄墊料高值轉化等技術問題,創新了以微生物發酵為核心的技術系統,實現了畜禽養殖污染控制與廢物資源化；通過多項技術的串聯應用示范,建立了以微生物發酵技術為核心的畜禽養殖污染控制與治理系統方案,取得了一定的社會效益和生態效益。該種養加一體化控制技術模式支撐了遼寧省以及河北省內縣的養殖污染治理。以養殖污染生態控制為主的種養加一體化控制方案已推廣到福建、山東、北京等20個省市,。

針對技術投資成本高、運行費用高或運行復雜、管理難度大的問題,水專項也通過對技術的投資和運行成本進行優化和核算,使技術更加實用。如研發的畜禽養殖廢物異位微生物發酵床處理與資源化利用技術,相比糞污厭氧工程+尾水深度凈化技術具有投資和運行成本低、操作簡單的特點,在有機肥銷路打通的情況下,不僅可以抵消墊料成本的費用,還可以增加額外收益,受到了養殖戶的廣泛歡迎。